新闻通稿

郑州, 05.12.2019

NGS技能落地病理科 加快分子确诊运用展开

当时,肿瘤个体化医治已从夸姣的愿景落实到临床实践,依据分子分型的靶向医治、免疫医治等精准医治手法使肿瘤患者生存期及日子质量得到显着前进。在这一趋势下,以新一代测序(NGS)技能为代表的靶向精准检测办法逐步从科研实验室走向临床病理科的实践运用中。

2019我国病理年会期间,betway确诊约请到我国分子病理范畴闻名专家学者参加“NGS助力分子病理临床研讨专题研讨会”,一起讨论NGS在分子病理确诊中的运用前沿展开。中华医学会病理学分会常委兼秘书长、首都医科大学宣武医院病理科卢德宏教授担任会议主席并表明:“NGS等先进检测技能的展开正推进着病理学科加快革新。进入精准医疗年代,病理学科的重要性更加凸显,怎么充分发挥分子病理等新兴学组的临床价值是咱们每一位病理医师需求重视的要点。”

 

中华医学会病理学分会常委兼秘书长、首都医科大学宣武医院病理科卢德宏教授

 

NGS:现代临床实践的必经之路

“精准医疗要求病理医师把握患者尽或许具体的信息,包含年纪、性别、基因、既往疾病史、宗族谱系、成长环境、日子办法等。个体化差异会影响每位患者的疾病特征,也意味着每个人的疾病防备、确诊和医治办法或许不同。”苏州大学隶属榜首医院病理科主任郭凌川教授指出,“现代病理医师的作业不再仅仅是供给一个确诊成果,而是整合一切患者信息给予临床疾病全程办理的辅导。”

 

中华医学会病理学分会常委兼秘书长、首都医科大学宣武医院病理科卢德宏教授

 

分子生物学、分子遗传学技能的前进推进着病理确诊从传统的形态学深化至分子层面研讨,经过剖析肿瘤患者的基因异常情况,包含常见的基因扩增、染色体异位/基因交融、基因骤变、基因重排、甲基化、微卫星不稳定(MSI)等,为病理确诊、临床医治供给更多有价值的信息,发现对不同医治办法更为灵敏、效果更好的患者集体,有助于临床拟定个体化医治计划,辅导随同确诊用药、监测效果及判别预后等。

今日,分子病理确诊技能已运用在肺癌、结直肠癌、淋巴癌、乳腺癌等临床常见肿瘤的医治中。其间,NGS技能比较双脱氧法测序(sanger)、聚合酶链式反响(PCR)等传统检测办法具有显着的通量优势,可在一次检测中对上百万乃至数十亿个DNA分子进行大规模重测序,然后给出更为全面的疾病基因谱。此外,NGS可一起对数百种基因的骤变、刺进缺失、交融、拷贝数变异进行检测,特别关于形态学确诊有争议的疑问病例,NGS技能可以最大程度上协助患者找到有用的医治靶点和预后标志物,完成真实含义上的“精准医疗”。相关于传统病理检测,NGS技能具有更快速度、更高通量、低本钱人员依靠、省时、省样本、节省本钱等优势,且能供给更丰厚的信息以及更多医治挑选等优势。

临床上,针对肿瘤基因外显子或单核苷酸多态性(SNP)位点进行NGS检测,可用于判别家系成员的患病危险。针对乳腺癌、结直肠癌等具有遗传性倾向的癌症(如图1),美国国立归纳癌症网络(NCCN)给出了清晰的危险评价及防备监测辅导,要求契合遗传学入组标准的人群进行相关易感基因骤变检测,并依据评价成果挑选适宜的防备或干涉办法,在肿瘤防治作业中具有重要实用价值与含义。

 

NGS辅导肿瘤精准医治

郭凌川教授表明:“依据NGS的肿瘤安排体细胞骤变检测可以供给辅导多种肿瘤的靶向用药信息。结合临床实践需求,咱们可以为患者灵敏规划特定病种的靶向测序计划,找到可以完成临床获益的分子骤变。需求留意的是,肿瘤在展开过程中,因为微环境的改动或药物干涉后疾病或许发生变异,需求实时监测并调整医治计划。”

肿瘤骤变负荷(TMB)是免疫医治中运用最多的分子标志物之一。2017年《新英格兰杂志》宣布的27种癌症的TMB与运用PD-1/PD-L1抑制剂医治有效率的剖析显现:各大常见肿瘤接纳PD-1抑制剂医治的有效率和TMB巨细简直呈线性关系(如图2),即TMB越高,PD-1抑制剂有效性越高。[1]

 

2018美国临床肿瘤学会(ASCO)年会上,来自瑞士洛桑大学医院的Solange Peters教授总结了晚期NSCLC免疫医治前沿展开(如图3),提出TMB与PD-L1表达并不彻底相关,需求两种生物标志物联合运用。

 

值得留意的是,免疫医治或许引起负反响,乃至呈现免疫医治超展开(HPD),即PD-1/PD-L1医治前后肿瘤增长速度(TGR)肯定添加超越每月50%,这与MDM2/MDM4 扩增/骤变、EGFR骤变、DNMT3A骤变、11q13扩增、CDKN2A/B缺失等有关(如图4)。这些基因检测可以及时提示患者医治是否呈现HPD。此外,HPD还和年纪相关,年纪较大患者简单呈现HPD。

 

图4:免疫医治相关分子标志物[2]

 

先声确诊商场高档总监宋超介绍道:“完好、全面的基因检测不只要助于临床拟定医治计划,其耐药检测剖析能协助靶向耐药患者及时替换适宜的靶向药物,关于稀有骤变的发现则有利于辅导科研方向。最新发布的多项研讨显现,某些驱动基因阳性的患者免疫医治获益较差,对此类患者及时进行全面的基因检测,才干协助他们尽早更改医治计划,前进效果。”

 

先声确诊商场高档总监宋超

 

加强质控 标准NGS技能在病理科的运用

样本的不同处理状况会直接影响NGS的检测成果,因而,对样本制备的质量操控不容忽视。《肿瘤个体化医治检测技能攻略(试行)》主张样本选用10%中性福尔马林固定,按病理学操作标准进行选材;活检标本固定24小时,穿刺样本固定时刻操控在6-24小时为佳;样本经1周以上的长时刻浸泡后部分DNA会被片段化,并不能检出骤变,对确诊成果产生影响。

在安排切片方面,主张切取5张接连切片,其间1片进行HE染色,承认肿瘤细胞的含量。过低的肿瘤安排含量会直接影响肿瘤基因骤变丰度,形成假阴性,因而,每张切片肿瘤安排的含量至少在70%以上。

跟着介入技能的前进,穿刺小标本检测添加了安排标本的获取途径。穿刺白腊标本进行NGS检测可以供给更直接的信息,1-2张白腊切片(2ng DNA)即可满意测序需求。不同检测办法DNA样本开始量不同,全基因组测序(WGS)DNA开始量2-5 ug,全外显子测序(WES)和靶向测序均为1-2 ug,其间靶向测序是现在临床展开较为常见的测序办法。

“最新的NGS技能不只可以定性,还能定量,这将大大有利于临床决议计划的拟定,但对检测成果的准确性也提出了更高的要求。”郭凌川教授着重,“从样本到出具陈述的每个环节都需求进行质控,其间包含样本DNA/RNA质控、DNA文库质控等,只要经过谨慎的质控才干保证陈述成果的准确性。”

作为NGS技能范畴的开拓者和领导者,betway确诊具有从样本前处理、核酸纯化、PCR系统装备到检测渠道的分子检测自动化全体解决计划,经过不断创新与晋级,为分子病理确诊展开供给强有力支撑。

 

 

 

[1] N Engl J Med. 2017 Dec 21;377(25):2500-2501.

[2] Nat Rev Cancer. 2019 Mar;19(3):133-150.